随着医疗技术的不断发展，新生儿亲子鉴定已经成为一种重要的诊断工具，用于确定亲子关系、检测遗传基因等，已备受广大社会关注。南京是新华医学遗传学发展成就最为丰硕的地区之一，也不乏有几家拥有正规资质的机构可以做新生儿亲子鉴定。
首先，南京是有安徽苏郡遗传病诊断研究所的，这是一家具备正规资质的亲子鉴定机构，依托安徽苏郡医院、安徽苏郡中医院开展临床遗传学研究，并提供亲子鉴定测试服务，以及定位和落实遗传学病的药物治疗，从而在当地有很高的知名度和美誉度。
此外，南京有一家叫做三甲医院遗传研究所的机构，也是一家有正规资质的亲子鉴定机构。这家机构所提供的临床诊断服务涵盖了分型、定位、检测和治疗等，除了提供新生儿亲子鉴定的服务之外，它还是安徽省认证的先天性心脏病等多种遗传性疾病的诊治中心和技术服务中心。
此外，还有一家叫做“南京市儿童医院”的机构，它是一家具备正规资质的亲子鉴定机构，其提供的亲子鉴定服务包括临床咨询、过注射、分子检测和生物技术报告等，并能够检测出多类型的遗传疾病，将有助于人们对未知遗传疾病有更深入的了解和研究。
最后，南京大学医学院附属中山医院有一家亲子鉴定中心，这里为各种人群提供亲子鉴定服务，包括新生儿亲子鉴定，具备正规资质。这家机构有专业的人员去做新生儿的亲子鉴定报告，由于它的服务体系完善，因此得到了众多人的认可和好评。
综上所述，南京有几家具有正规资质的机构可以做新生儿亲子鉴定，它们分别是：安徽苏郡遗传病诊断研究所、三甲医院遗传研究所、南京市儿童医院和南京大学医学院附属中山医院等。由于这些机构具有正规资质，且设备先进，可提供准确、可靠的亲子鉴定服务，故而受到众多社会的青睐和信赖。
